根据《古今图书集成》记载，奇门遁甲起源于四千六百多年前，轩辕黄帝大战蚩尤之时。当时黄帝和蚩尤在涿鹿展开一场前所未有的大战，蚩尤身高七尺，铁头铜身刀枪不入，而且会呼风唤雨，他在战场上制造迷雾，使得黄帝的部队迷失方向。
有一天晚上，三更半夜大家都在睡觉的时候，忽然，轩辕丘上传来惊天动地的声音以及非常强烈的光芒，惊醒了黄帝及众人。于是大家匆忙起床，跑过去一看，原来是有一支彩虹自天空中缓缓下降，从中走出一位全身大放光明的仙女，手上捧着一个长九寸阔八寸的玉匣。黄帝接过来打开一看，里面有一本天篆文册龙甲神章，黄帝根据书里面的记载制造指南车终于打败了蚩尤。
龙甲神章除了记载兵器的打造方法之外，还记载了很多行军打仗遣兵调将的兵法。于是黄帝要他的宰相风后把龙甲神章演绎成兵法十三章，孤虚法十二章，奇门遁甲一千零八十局。
后来经过周朝姜太公、汉代黄石老人，再传给张良，张良把它精简之后变成现在我们看到的奇门遁甲。
奇门遁甲的分类
奇门遁甲可分为五大类：
1、法奇门：以符咒密法为主
2、术奇门：以特殊技巧为主
3、阵奇门：以八阵图为主
4、卦奇门：可预知朝代的兴旺更替等
5、数奇门：根据时间与空间的推衍，以达到趋吉避凶之功用，也可转败为胜
（四）奇门遁甲的现代功能及运用
因为奇门遁甲是一种时空交替的磁场表现，以前封建时代皇室用以来遣兵调将出奇制胜，现在我们则用以推算出某个时间的吉方，来增加事情成功率，如求财、考试、求职、索债、求医、旅行、博戏、战斗、围捕盗贼等都有很好的效果。
（五）奇门遁甲八门吉凶
所谓八门是指奇门遁甲跟据八卦方位所定的八个不同角度，总分吉门和凶门：
(1)休门：求财、嫁娶、远行、新官上任等诸事皆宜。休门的气比较轻松，故很适合出外旅游或非正式的商业活动。
(2)生门：谋财、求职、做生意、远行、嫁取等诸事皆宜。生门有生生不息的意思，故最适合求财做生意或有病求医。
(3)伤门：伤门意为破坏的磁场，若强出伤门易见血光，故一般吉事皆不宜，但适合钓鱼打猎、博戏、索债或围捕盗贼，利刑事诉讼。
(4)杜门：杜门有隐藏的意思，适合隐身藏形躲灾避难，于诸事皆不宜，若要躲起来不让人发现杜门最适合。
(5)景门：景门是八门之中除开休生三门之外另一吉门。景门最利考试、广告宣传活动、远行婚姻嫁娶等皆宜。
(6)死门：死门最凶，除吊丧捕猎之外其馀诸事不宜。
(7)惊门：惊门有惊恐怪异之意思，若强出此门易遇惊慌恐乱之事，利民事诉讼。
(8)开门：宜远行，利求职、新官上任、求财、婚姻嫁娶、访友、见贵人，不宜政治阴私之事，易被他人窥见。
（六）奇门遁甲的排局布盘
奇门遁甲的具体应用，是通过排局布盘来进行的。所谓排局布盘，就是按照不同的年份、节令、时辰，将八门(休、生、伤、杜、景、死、惊、开)、九星(天蓬、天芮、天冲、天辅、天禽、天心、天柱、天任、天英)、九神，在洛书九宫上布出适当的组合，依此判断吉凶方位。所谓局，有阳遁九局和阴遁九局共十八局。
排局布盘
经云：穷则变，变则通也。动者，生吉凶也。动何能生吉凶?由时间，空间配合而生之差异，配合之妙，自由吉祥；配合不妙，便有凶事。时间，吉日良晨也。空间，方位也。两者合之，古人之奇门遁甲者也。
奇门遁甲的产生与军事切切相关，自古被称为帝王之学。其用途大致有两个方面：其一是法术方面，主要是道教中的玄学，如遁法、隐身法、障眼法等，甚至呼风唤雨；其二实择吉占验，用来预测在什么时间，什么方位干什么有利，在什么时间，什么方位干什么不利。
遁甲之法，以甲乃太乙人君之象，为十干之首，常隐于六仪之下(六仪者，戊己庚辛壬癸也)，故谓之遁甲。所畏者，庚金也。金能克甲木，庚为七煞之首也。乙乃甲之妹，甲以妹乙嫁于庚，乙与庚合而能救甲，故乙为一奇。丙为甲之子，丙火能克庚金而救甲，故丙为二奇。丁为甲之女，丁火亦能克庚金而救甲，故丁为三奇。
排遁甲盘分为八个步骤：
时辰干支-阳遁/阴遁-地盘-天盘-九宫-八门-九星-九神
（七）奇门九字诀
“临兵斗者皆阵列前行”，凡此九字长念之，无所不避。口中常念此九字，可以驱吉避凶，运气不好可以转运；如出门在外，上车前，搭船前，念此九字，亦可保平安；在外住宿若怕房间不干净，念此九字，诸邪不侵，可保一夜安眠到天亮。