与卡卡西等人汇聚在一起，十二小强也逐渐苏醒过来。卡卡西给他们分配了追踪佐助，并阻止佐助的行动，众人接了这个特殊的A级任务。
与此同时，在结界内，三代和大蛇丸展开了战斗，只是结界外的人只能看到里面的情况，却无法进入其中帮忙。
三代猿飞日斩，作为木叶村的第三代火影，是初代目火影和第二代火影的亲传弟子，培育出威震忍界的“三忍”。其拥有并精通五属性忍术，曾经享有“忍术教授”的称号，被誉为历代最强火影。
但是此时的他已经69岁了，身体机能早已经老化，没有当初那般的厉害。若不是第四代火影舍己救村，导致火影之位悬空，他也不至于复位。但他早已经不是曾经那个忍者之神。
面对曾经的弟子，如今的对手，大蛇丸，猿飞日斩自己也不清楚自己还有没有能力战胜对方。
看着自己的弟子，依然那副黑色长发，金色的纵长瞳孔，紫色演唱到鼻翼的眼影，还有苍白的皮肤。那带着青蓝色的勾玉状耳环，给人感觉到阴险。正是这个弟子，曾经几乎学的自己所有的忍术，但最终却背叛了村子。
“看来要出去是没有那么容易了。”
“可别这样说，对你而言，让那几个家伙进来反而会分你的神，对吧，猿飞老师。”
“虽然我曾经想过我们会有这样一天，面对面地战斗，但却没有想到会这么早，大蛇丸，你是我教出的弟子，我一定要亲手铲除你这个危害。”
战斗一触即发，猿飞日斩一上来便使用“忍术·瓦片手里剑”攻击大蛇丸，但轻易被大蛇丸躲过，对方还以颜色、以“潜影蛇手”袭击他；那从大蛇丸口中飞射而出的长蛇猛然咬住了三代老头的脖子，正在大蛇丸准备耻笑一番对方的时候，却发现那不过这只是他的“土替身”。
接着，三代便直接以“土遁·土流大河”、“土遁·土龙弹”及“火遁·火龙弹”袭击大蛇丸，但大蛇丸可不是什么泛泛之辈，虽然不敢再轻视三代目，但亦扬言自己不过这么简单被解决。
见此，大蛇丸索性要求三代认真决战来个了断，不要再做无谓的游戏试探。三代选择‘应邀’脱去火影制服，显露其忍者战装。大蛇丸也暴露出自己的忍者战斗模式，两人猛然的爆发，强大的查克拉是否释放而出，直接令空间内的气氛愈加激烈起来
很快，两人便迎着对方奔袭而去。三代迅速地从口袋中掏出手里剑射飞出去，并在使用“手里剑影分术”之时，大蛇丸终于使用他的终极秘技“禁忌通灵术·秽土转生”，把三代的老师“初代火影?千手柱间”及“二代火影?千手扉间”召唤出来。
甚至更一度欲把“四代火影?波风水门”也召唤出来，但四代火影曾使用“禁忌封印术?尸鬼封尽”拯救木叶村免受“九尾妖狐”摧残故灵魂已由死神保管无法召唤。又或者是三代之力地抵挡，使得四代并没有能够走出来。
面对自己的两名老师，三代目也知情况艰难，指责大蛇丸竟然还愚弄死去的两名火影，要他们死去后还需战斗。大蛇丸在两名火影头上插入符咒后，他们会回复肉体，但已失去任何意志，只是任大蛇丸操控的傀儡而已。
初代及二代首先奔往攻击三代，被三代击开、及再以“火遁·火龙炎弹”攻击他们。面对火的攻势，擅长水遁的二代在没有水的情况下，仍能施展“水遁·水阵壁”阻挡，再反过来以“水遁·水冲波”做成巨浪准备淹盖三代。
三代随即利用“土遁·土流壁”筑成巨岩阻挡洪水;但就在从岩石返归城楼上之际，先后被初代拳打脚踢及被二代拉进水里，在挣脱下才逃回土壁之上。二代目继续向土壁上的三代攻击，射出水柱击溃土壁，三代再度落在城楼之上。
此时初代不甘示弱，展现其“血继限界·木遁”，使出“木遁·树海降临”之术，在城楼上长出树木牢牢抓住三代。三代无法解开树枝的缠绕，于是以“通灵”召唤出战友“猿猴王”猿魔，并令其化为“金钢如意棒”斩断缠绕着的树枝。
得到友魔“猿猴王”猿魔的协助，三代使用其化成的“金钢如意棒”作为武器，跟大蛇丸从口中拿出的“草薙之剑·空之太刀”对战，一度难分高下。但随即初代及二代纷纷来犯，他没法同时对战三人，只好在初代及二代肢体上留下引爆符，就即被大蛇丸踢飞。
大蛇丸一度走近被击于城楼面上的三代，称对其表示失望；三代亦一度因为想起童年的大蛇丸而流泪起来。但不久三代即重拾战意，以极其敏捷身手攻击大蛇丸，猿魔亦从如意棒中把手伸出、并欲勒死大蛇丸。
但这个时候，大蛇丸即时化为泥泞以逃出猿魔的掐杀，并向三代展示自己脸皮底下的第二真面目--就是利用“不死转生”、而成功侵占肉体的年轻女忍者面孔。大蛇丸表示这只是他第二次转生的容器，而下一个目标就是拥有写轮眼的宇智波佐助。
三代这个时候引爆初代及二代身上的引爆符，以顺利阻止两者的攻击；然而他们“秽土转生”的肉体可立即修补过来。修复身躯后的两名火影，再次对徒儿三代继续攻击。
初代使用木遁术欲再抓击三代，但幸亏猿魔化成“金钢牢壁”及时保护他。二代亦使用“黑夜行”，使三代处于黑暗环境当中，并受其攻击。三代无可奈何下，决定分出两个影分身，再由两个分身份别对初代及二代施行禁术“封印术·尸鬼封尽”。
初代及二代被封印时，对伤害三代之事表示遗憾；而在他们消失后，三代却惊觉原来是两名音忍-萨克及琴被当作牺牲品、以施行“秽土转生”这种禁术。这对一向视生命为至贵的三代来说，实在不可原谅，更决心要把这个叛徒杀掉。
他召来“金钢如意棒”，把大蛇丸手中的“草薙之剑·空之太刀”打飞，并在接近大蛇丸的情况下再次施行--“禁忌封印术·尸鬼封尽”；而大蛇丸使出“潜影蛇手”欲缠着三代，但却缠着了其通灵兽猿魔。
他对大蛇丸称此术不单施术者灵魂会被死神吞噬而死亡，被施术者也要永远活在死神体内受尽折磨。大蛇丸看见死神心也慌了，召回被击飞的“草薙之剑·空之太刀”，从后偷袭三代。
猿魔见状本想握住飞往三代的剑，但因身体被蛇缠绊著，当它拿到时已有一半刺穿三代的身躯。双方一度对峙不下，大蛇丸不断用剑贯穿三代的身躯，而三代亦不断尝试不大蛇丸的灵体从身躯扯出来。
最后因为三代自知力量不够，已无能力把大蛇丸整个灵体抽出，故决定只透过死神把大蛇丸双手废去，使其永远不能结印以使用忍术。他深信木叶‘火之意志’一定会继承下去，所以倒下时仍带着微笑、及再次看到童年的大蛇丸，接着便从此一睡不起。他的召唤兽猿魔因为失去召唤者亦瞬间消失了，大蛇丸也因失去战斗能力、在‘音忍四人众’保护下离去。